一、来源不同
蜂巢素是人工提取蜂巢中的有效成分并精制成的，生产蜂巢素的材料是蜜蜂的巢脾(主要成分是蜂蜡)，而蜂巢蜜则是蜜蜂完全酿制成熟并封盖的蜜脾，也就是说蜂巢蜜实际上是连巢带蜜一起食用的，因此蜂巢素和蜂巢蜜从来源上看就是截然不同的两种东西。
二、成分不同
蜂巢素的主要成分是脂肪酸、鞣质、甙类、氨基酸、酶类及微量元素，蜂巢蜜主要是由蜂蜜和蜂巢构成的，其中蜂蜜的主要成分是葡萄糖和果糖，尚含少量的蔗糖、维生素、矿物质等成分，而蜂巢的主要成分是蜂蜡，并含少量的花粉、蜂胶、蜂王浆等成分。
三、功效不同
蜂巢素的作用主要是抗菌消炎，因此对鼻炎、咽炎、风湿性关节炎等有一定的效果，尤其可迅速缓解因过敏性鼻炎引起的鼻塞、流涕、头痛、头晕等不适症状，而蜂巢蜜则更侧重于作营养保健品食用，功效主要体现在增强免疫、抗菌消炎及缓解疲劳等方面。
四、价格不同
蜂巢素的价格因规格、品牌等不同而有差异，一般要30～50元左右一瓶(500毫升)，而蜂巢蜜大多要80～300元一斤，事实上不管是中蜂还是意蜂生产的蜂巢蜜都比较贵，尤其是中蜂生产的蜂巢蜜基本都在100元以上，因此从价格上看蜂巢蜜比蜂巢素贵得多。
总结：蜂巢素和蜂巢蜜实际上有着本质的区别，其中蜂巢素是用蜂巢为主要材料精制成的，而蜂巢蜜则是连蜂巢带蜂蜜一起食用的蜜脾，因此不要错误的认为蜂巢素和蜂巢蜜是一种东西。
