一、概念不同
蜂蜡和蜂巢是两个不同的概念，简单来说蜂巢是蜜蜂的家园(蜜蜂不管是生存还是繁衍都需要蜂巢)，而蜂蜡则是蜂群中适龄工蜂(13～18日龄)分泌的脂肪性物质，但蜂巢和蜂蜡之间存在着必然的联系，因为蜂巢的主要成分就是蜂蜡，在养蜂生产中养蜂人会将淘汰的老旧巢脾融化后提炼蜂蜡。
二、作用不同
蜂巢是蜂群生存和繁衍的必需品，因为不管是储存食物(蜜蜂用巢房储存蜂蜜或花粉)还是哺育幼虫(蜜蜂在巢房中哺育幼虫)都需要蜂巢，而蜂蜡的主要作用是修筑蜂巢(蜂巢的主要结构是巢脾，巢脾则是由巢房组成的，而巢房是用蜂蜡制成的)，从这点来看蜂蜡和蜂巢的区别类似于砖和房子。
三、成分不同
蜂蜡和蜂巢在成分上有极大的区别，其中蜂蜡的主要成分是脂类、酸类、醇类和烃类，尚含少量的挥发油、着色素、矿物质及芳香性物质等成分，而蜂巢则是蜂蜡、蜂蜜、蜂胶、蜂王浆、蜂花粉及蜂茧衣的集合体，也就是说蜂蜡含有的所有成分在蜂巢中都存在，两者是包含与被包含的关系。
四、功效不同
蜂蜡和蜂巢在功效上差异非常明显，其中蜂蜡的主要功效是抗菌消炎、去腐生肌，因此多用于鼻炎、咽炎等呼吸道炎症及烧伤、烫伤等外部创伤，而蜂巢的主要功效是增强免疫力、抗菌消炎及降脂降压，特别适合于免疫低下、体弱多病、局部炎症及高血压、高血脂、高血糖等患者保健食用。
总结：蜂巢(主要成分是蜂蜡，融化后可提炼蜂蜡)是蜜蜂的家园，事实上两者最大的区别是成分不同，因为在蜂巢中除了含有大量的蜂蜡外尚含少量蜂蜜、蜂胶、蜂王浆、蜂花粉及蜂茧衣等成分。
