一、蜂种不同
土蜂蜜和意蜂蜜是不同蜂种酿制而成的，其中土蜂蜜是土蜂采集花蜜酿制而成的，土蜂实际上是我国分布极为广泛的中蜂，对我国的自然环境有着极强的适应能力，而意蜂蜜则是意蜂采集花蜜酿制而成的，意蜂是上个世纪引入我国的优良蜂种，具有采集力强且生产性能高的优点。
二、蜜源不同
土蜂蜜和意蜂蜜在蜜源上有明显的区别，其中土蜂对蜜源没有什么高的要求，只要在采集范围内不管是大蜜源还是零星蜜源无所谓，因此土蜂蜜的蜜源非常复杂且多变，而意蜂只对大宗蜜源有采集欲望，比较适合用于生产高纯度的单花蜜，例如槐花蜜、枣花蜜等都是意蜂生产的。
三、产量不同
土蜂蜜和意蜂蜜在产量上差异特别明显，其中土蜂对大宗蜜源的采集力比不上意蜂，加之其某些特性也比较适合定点养殖，因此在产量上要比意蜂蜜低得多，一般每年的产量只有5～15斤左右，而意蜂蜜的产量则是以百为单位的，事实上这也是为什么意蜂蜜能主导蜂蜜市场的原因。
四、价格不同
土蜂蜜和意蜂蜜在价格上有巨大的差异，其中土蜂蜜因产量稀缺且多为自然成熟蜜而略显昂贵，而意蜂蜜则因产量高且能生产“水蜜”而相对便宜，如果说土蜂蜜走的是精品高端路线的话，那么意蜂蜜基本上就是靠产量来取胜的，也就是说实际上意蜂蜜才是真正意义上的商品蜜。
总结：土蜂蜜和意蜂蜜都是蜜蜂采集花蜜酿制的，虽然从主要成分上看二者区别并不明显，但土蜂蜜因产量稀缺且多为成熟蜜而更显昂贵，事实上从两者的市场价格上就已经基本体现出来了。
