1、清理蜡屑：清理蜡屑能有效防止蜂箱里生巢虫，事实上巢虫最开始是在箱底或蜂箱缝隙处孵化的，孵化后的巢虫会想方设法爬到巢脾上去蛀食蜡质，及时清理掉落在箱底的蜡屑可明显降低巢虫滋生的可能性。
2、饲养强群：饲养强群是防治巢虫最有效的办法，原因是强群对巢虫有极强的抵抗力，因此养蜂生产中一定要想办法将蜂群养成强群，例如蜂群育虫积极性低时可适当奖励饲喂以刺激蜂王产卵和激励工蜂育虫。
3、喷洒药物：巢虫危害严重时可以采用药物防治，例如可用二硫化碳、甲酸、二氧化硫等熏闷巢脾和蜂箱，也可在蜂箱内悬挂巢虫清木片诱使巢虫啃食，还可向受害巢脾喷洒巢虫净、巢虫清灭灵等巢虫专用药。
综上所述，巢虫是蜡螟的幼虫，主要危害中蜂，尤以弱群最易受害，轻者影响蜂群正常发展，严重时蜂群因无法抵抗不得不弃巢迁飞，防治巢虫最有效的办法是及时清理箱底蜡屑并将蜂群饲养成强群，若巢虫危害严重要喷施巢虫净、巢虫清灭灵等巢虫专用药。
