1、桉树蜂蜜长期过量食用极易导致肥胖，原因是桉树蜂蜜中含有大量的葡萄糖和果糖，虽然葡萄糖和果糖都是单糖且相对不易转化成脂肪，但并不是说单糖就完全不能转化成脂肪，事实上长期过量摄入单糖也是完全能引起肥胖的。
2、桉树蜂蜜空腹食用极易引发胃肠疾病，原因是桉树蜂蜜中富含有机酸等酸性物质，加之喝桉树蜂蜜又能促使胃部大量的分泌胃酸，若空腹食用这些酸性物质将直接刺激胃肠粘膜，从而极易引发胃溃疡甚至胃穿孔等严重胃肠问题。
3、桉树蜂蜜在临睡前食用不利于心血管，原因是桉树蜂蜜中富含极易被人体吸收的单糖，晚上睡觉后人体血液本身就缺水而格外粘稠，若喝完桉树蜂蜜就睡觉则将加重血液粘稠度，事实上很多心血管疾病都是血液太粘稠而引起的。
