一、肥胖
长期过量喝蜂蜜易导致肥胖，原因是蜂蜜中葡萄糖和果糖等单糖的含量可高达70%以上，虽然单糖相对而言较不易转化成脂肪，但并不是说单糖就完全不能转化成脂肪，事实上长期过量喝蜂蜜也极易因单糖摄入过量而引起肥胖，尤其是对本身运动量就偏小的人群来说则更容易发胖。
二、胃酸过多
长期空腹喝蜂蜜易导致胃酸过多，原因是蜂蜜中含有大量的机酸等酸性物质，加之喝蜂蜜还能促使胃部大量的分泌胃酸，若长期空腹食用则极易引起胃酸过多，严重时还可能因胃酸过多而引发胃溃疡甚至胃穿孔等胃肠疾病，因此蜂蜜最好是选择在饭后1～2小时或睡前1～2小时喝。
三、龋齿
长期临睡时喝蜂蜜易引发龋齿，原因是蜂蜜中富含葡萄糖和果糖等糖类物质，喝蜂蜜后若不及时刷牙或漱口则残留的糖类物质便会成为细菌的天堂，细菌在代谢糖分的同时会产生大量的酸性物质，牙齿长期在酸性物质的腐蚀下便会引发龋齿，因此喝蜂蜜后一定要及时刷牙或漱口。
四、糖尿病
长期过量喝蜂蜜易间接引发糖尿病，原因是蜂蜜中富含的葡萄糖和果糖等糖类物质，虽然喝蜂蜜和糖尿病本身并没有直接的联系，但长期过量喝蜂蜜极易因糖分摄入过量而导致肥胖，事实上过度肥胖又恰恰是糖尿病的重要诱因，因此喝蜂蜜时一定要根据自身的情况控制好食用量。
五、中毒
长期喝劣质蜂蜜易引起中毒，原因是有些养蜂人在固定巢脾时往往会用到铅丝，从而导致蜂蜜中不可避免的含有些铅、砷等重金属，若长期喝这种蜂蜜则易因重金属堆积而引起中毒，另外蜂蜜在采收和存储过程中也容易被致病菌污染，因此一定要到正规养蜂场或商家去购买蜂蜜。
综上所述，蜂蜜的副作用实际上都源于不正确的食用，例如长期过量喝蜂蜜易因糖分摄入过量而导致肥胖，长期空腹喝蜂蜜则易因胃酸过多而引发胃肠疾病，另外喝蜂蜜后若不及时刷牙或漱口也易引发龋齿。
