一、科属不同
1、芦蒿：芦蒿是著名的经济作物，学名蒌蒿，别称藜蒿、水蒿、荑蒿等，在生物学分类上属于植物界、被子植物门、双子叶植物纲、桔梗目、菊科、蒿属多年生草本植物。
2、茼蒿：茼蒿是著名的经济作物，别称蓬蒿、蒿菜、塘蒿等，在生物学分类上属于植物界、被子植物门、双子叶植物纲、桔梗目、菊科、茼蒿属一年生或二年生草本植物。
二、形态特征
1、芦蒿：芦蒿主根不明显或稍明显，根状茎稍粗、直立或斜向，茎少数或单生，叶纸质或薄纸质，头状花序多数，长圆形或宽卵形，在分枝上排成密穗状花序，并在茎上组成圆锥花序，瘦果卵形，花果期7～10月。
2、茼蒿：茼蒿茎不分枝或自中上部分枝，叶互生，基生叶花期枯萎，中下部茎叶长椭圆形或长椭圆状倒卵形，上部叶较小，头状花序单生茎顶或少数聚生茎枝顶端，小花黄色或白色，瘦果有棱，花、果期6～8月。
三、产地分布
1、芦蒿：芦蒿的分布范围极为广泛，我国南北各地普遍都有分布，蒙古、朝鲜半岛、俄罗斯西伯利亚及远东地区等地也有分布，多生于低海拔地区的河湖岸边和沼泽地带。
2、茼蒿：茼蒿原产于地中海沿海，在我国已有900余年的栽培历史，安徽、福建、广东、广西、海南、河北、湖北、湖南、吉林、山东等地均有栽培，但栽培面积普遍较小。
四、生长习性
1、芦蒿：芦蒿属于长日照植物，喜温暖，耐寒，生长适温15～25℃，耐湿，在旱地和浅水中均可生长，对土壤要求不严，在黏重、瘠薄的土壤中生长不良，强光下嫩茎容易提前老化
2、茼蒿：茼蒿属于短日照植物，喜温暖，半耐寒，生长适温15～25℃，温度低于8℃受冻害，不耐旱，最适土壤湿度70～80%，对土壤要求不严，在长日照条件下很快会进入生殖生长。
