1、忌空腹饮用：原因是柠檬蜂蜜水中富含有机酸等酸性物质，加之喝柠檬蜂蜜水还能促使胃部大量分泌胃酸，若长期空腹饮用易因胃酸过多而引发胃溃疡甚至胃穿孔等胃肠疾病，事实上柠檬蜂蜜水一般建议在饭后1～2小时再喝。
2、忌过量饮用：原因是柠檬蜂蜜水中富含葡萄糖和果糖等单糖，单糖虽然相对较不易转化成脂肪，但并不是完全不能转化成脂肪，若长期过量饮用极易因单糖摄入过量而导致肥胖，另外长期过量喝柠檬蜂蜜水也易引起胃酸过多。
3、忌高温冲泡：原因是活性物质是蜂蜜最具代表的营养物质，但这些活性物质对温度敏感且高温下易失去活性，例如水温高于60℃时蜂蜜的营养价值便会因活性物质失活而降低，因此冲柠檬蜂蜜水要等水温低于60℃后再加蜂蜜。
4、忌冲泡过浓：原因是柠檬蜂蜜水中富含有机酸等酸性物质，若冲泡得过浓极易因胃酸过多而引发胃溃疡甚至胃穿孔等胃肠疾病，同时柠檬蜂蜜水中还富含葡萄糖和果糖等单糖，若冲泡过浓也极易因单糖摄入过量而越喝越肥胖。
综上所述，喝柠檬蜂蜜水的禁忌主要有以下四个，其一是空腹饮用易因胃酸过多而引发胃肠疾病，其二是过量饮用易因单糖摄入过量而导致肥胖，其三是高温冲泡易因活性物质失活而降低营养价值，其四是冲泡过浓易引起胃酸过多并易导致肥胖。
