1、物理防治：巢虫是蜡螟的幼虫，蜡螟有趋光性，因此可利用黑光灯诱杀蜡螟，具体操作时黑光灯要设计成内外两层，外层孔格比蜜蜂小以防蜜蜂扑灯，内层接入电源用于杀死蜡螟。
2、药物防治：巢虫危害严重时可以采用药物防治，例如可用二硫化碳、甲酸、二氧化硫等熏闷巢脾和蜂箱，也可在蜂箱内部悬挂巢虫清木片，还可向受害巢脾喷洒康宽巢虫净等药物。
3、生物防治：巢虫在自然界中有很多的天敌，例如球孢白僵菌、苏云金芽孢杆菌、核型多角体病毒等微生物，蜡螟绒茧蜂、麦蛾绒茧蜂、蜡螟大腿小蜂等寄生性蜂类都是巢虫的天敌。
综上所述，巢虫(蜡螟的幼虫)是中蜂最主要的敌害，主要危害弱群，轻者影响蜂群的生产效率，严重时蜂群不得不弃巢迁飞，养蜂生产中可用黑光灯诱杀蜡螟，也可巢虫清木片、巢虫净等灭杀巢虫，还可利用蜡螟绒茧蜂、蜡螟大腿小蜂等天敌防控巢虫。
